该项目详细调查了海南黑山羊品种特征、群体分布、饲养情况，系统测定了海南黑山羊各种生产性能指标，并研究了部分生产性能间的相互关系；测定了海南黑山羊生理生化指标，并探讨了利用其血液生化指标进行间接选种的可能性，为海南黑山羊的选种选育奠定了理论基础；估计了海南黑山羊生长性状与繁殖性状的遗传参数，为制定选择计划、计算遗传进展及制定育种方案提供了数据基础，填补了海南黑山羊育种方面的空白；从分子水平分析了海南黑山羊、雷州山羊、隆林山羊等主要热带亚热带地区山羊品种群体遗传结构与品种之间的遗传关系；对海南黑山羊进行SNP检测，为海南黑山羊的经济性状与基因的关联性研究提供了基础资料。